《药师琉璃光如来本愿功德经》注释
第一部分 释经题
佛说每一部经，都有一个经名，本经的全名为《药师琉璃光如来本愿功德经》，简称药师经。经名开宗明义地告诉我们，此经阐述的是药师如来在未成佛的本因位上，发大愿、立大志所成就的功勋德业。经名亦告诉人们，这部经是已获修行成功，已成为“药师琉璃光如来”的药师佛。《药师琉璃光如来本愿功德经》是以人法立名的。“药师琉璃光如来”是佛的名号，“本愿功德”是佛法。但此处佛的名号中的“琉璃光”是个比喻，故此经亦可看作人法喻俱足的立名。
“药师琉璃光如来”为梵文Bhaigjyaguru-vaiduraprabhasa的意译，音译为“鞭杀社窭噜辟琉璃”，也可以意译为大医王如来。世间众生生理上有老病死苦，心理上有贪痴苦，佛法不仅能解除人们生理之苦，尤能消除人们心灵之苦，所以佛是最了不起的医生，被称作大医王。能治愈人们身心一切疾患，施法药之师就叫药师。《法华经》中称为“药王”。以琉璃光为佛名，显现佛德，比喻药师佛纯粹光明、洞澈表里的智慧之光。如来，十方一切佛的十种名号通称。如是真如，《成实论》说：“如来者，乘如实道来成正觉，如曰如来”。《金刚经》说：“如来者无所从来，亦无所去，故名如来。”如来是所有成佛者的共同称谓。所以药师佛也称作药师如来。
“本愿”指药师佛成佛以前，还处于菩萨修行的本因之位时，发下的誓愿，愿力是成功的动力，在愿力作用下成就的功勋德业就叫本愿功德。本经功德是指在寺院里所做佛事，功是功力，如行六度，德是即得，本经指修行得来成绩，名为功德。菩萨发的愿分为分别愿和总愿。总愿是所有菩萨的共同誓愿，显教菩萨的总愿是四宏誓愿。即：众生无边誓愿度;烦恼无尽誓愿断;法门无量誓愿学;佛道无上誓愿成。这四个宏大无边的誓愿是菩萨行苦集灭道四谛法的共同决心和意愿。菩萨的别愿是每个菩萨独有的誓愿，如本经的药师如来十二大愿，普贤菩萨的十愿，阿弥陀佛的四十八愿等。佛所说法，由弟子结集、会诵、记录整理成文，被称为修多罗(Sutra)。为了突出佛的言教能契理契机，所以也把修多罗译为契经。《华严经疏》说：“修多罗……，古译为契经，契谓契理契机，经谓贯穿摄化，即契理合机之经，所以将记录佛的言教所成的文字篇章称作经。《药师经》在我国有五种译本：
《药师经》在我国有五种译本：
(1)《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》又《佛说灌顶大神咒经》卷十二，是东晋?帛尸梨密多罗翻译，为最早的译本。
(2)《药师琉璃光经》一卷，是刘宋?慧简所译。
(3)《佛说药师如来本愿经》一卷，是隋?达磨笈多翻译。
(4)《药师琉璃光如来本愿功德经》一卷，唐?玄奘三藏翻译，通俗所谓《药师经》就是指这一卷。
(5)《佛说药师琉璃光七佛如来本愿功德经)二卷，唐?义净翻译，上卷述其他六佛之事，下卷述药师如来之事。
现在译成语体文是根据唐?玄奘三藏译本的流通本(印光老法师重刻本)，其中在玄奘原译本基础上增加东晋译本上八大菩萨名称，和义净译本上的神咒及其前后文二十多行。
当时释迦牟尼佛和他的弟子是印度人，所说的是梵浯，后来编集佛经，也用梵文写的;传到中国，用汉文和藏文翻译成中国文。本经是唐代玄奘三藏法师奉唐皇帝的诏命而翻译成汉文的。
三藏法师是全面精通“经藏”、”律藏”，“论藏”这三藏的法师，(藏是包藏的意思);此经、律、论三藏是佛教的经典，一般称为“大藏经”，又名“佛藏”。(如道教的经书叫“道藏”。)
玄奘三藏法师的简史：玄奘大师洛阳人，生于隋文帝开皇廿午(公元600年)，卒于唐高宗麟德元年(公元664年)，终年65岁(根据杨廷福教授考证，见《玄奘论集》第18页)。幼年聪悟，十三岁出家，廿岁受具足戒。因感众师讲经，各擅宗途，圣典亦显隐有异，莫知适从。发誓远游西方(印度)，以释众疑。乃於唐贞观二年(公元628年)私发长安，经凉州、出玉门、涉流沙辗转西行，经高昌，阿耆尼等国，度葱岭，越大雪山、遍历西域、印度诸国，前后十七年。他“遍谒众师;备飧异说”，学识渊博精诣，所以在五印度被誉为“大乘天”。将梵文佛经650多部，经中央东亚细亚东归，于贞观十九年(公元645年)正月抵长安，其时僧俗出迎者数十万众，唐太宗迎慰甚厚，诏于长安弘福寺从事翻译，大师网罗贤者，大开译场。当时长安的大慈恩寺，在玄奘法师译经的时候寺中常住七千余僧，极一时之盛。前后十九年间共译出重要经论75部，1335卷，计1300多万言，并特制《三藏圣教序》。故唐?三藏玄奘大师对我国佛教作出了不可磨灭的重大贡献。又《大唐西域记》为世界名著，这部书把他亲历的110个和传闻的28个域邦、地区、国家的山川形势、地理位置、历史沿革、风土习俗、气候物产、宗教信仰、文化语言、政治情况等作了实事求是的介绍;它涉及整个中、南亚广大地区的历史、地理，作了许多的记述。已有日、英、法文译本，是一部很有价值和影响的名著。
玄奘三藏法师是我国历史上的卓绝人物，也是世界性的历史人物，是国际上杰出的翻译家、旅行家、佛学家，亦是对中亚、南亚次大陆各国历史文化有着深远影响的历史人物。
第二部分 译经文
一般佛经经文都有三个部分，即序分、正宗分和流通分。现在即按此顺序作些注释。
一、序分
如是我闻。一时薄伽梵。游化诸国。至广严城。住乐音树下。与大比丘众八千人俱。菩萨摩诃萨三万六千。及国王大臣。婆罗门。居士。天龙八部。人非人等。无量大众。恭敬围绕。而为说法。
注释：如是我闻：是我亲自听到佛这样说表示证信。根据《智度论》卷二说：“佛入灭时，阿难问一切经首置何字?佛言‘如是我闻’等言。所以在诸经的开始，都有“如是我闻”四字，表示阿难亲自闻释迦牟尼佛所说，不是自己随便说的。
一时：指说法的时间。亦即举佛说法时以证信。意为某一时间。
薄伽梵：是梵文的音译，意译为“世尊”。
广严城：音译为毗耶离城。是印度恒河边的一个城市，在王舍城对面。
乐音树：不是真能奏音乐的树，而是其树成林，当微风吹动树枝、树叶时发出的种种自然的声音，听起来好像是在奏音乐。
与大比丘：即与会大众，道行很高的出家男众称大比丘。是梵文音译，意译为乞士。
菩萨摩诃萨：菩萨是梵文菩提萨垛的简称，意译为觉有情。是指修持大乘六度，求无上菩提(大觉)，利益众生，于未来成就佛果的修行者。
婆罗门：古印度四阶级之一。
居士：印度社会的第三阶级叫做吠舍，也就是一种自由民，其中富有的，有地位的绅士，称为居士，中国一般指在家学佛者，称为居士。
[10]天龙八部：天龙八部是八类众生的统称。他们分别是：天、龙、夜叉、乾达婆、阿修罗、迦楼罗、紧那罗、摩目候罗迦。这八类众生各有部属，所以叫八部。八部中以天、龙二部为首，所以用天、龙作八部的代表。
天，梵文Deva(提婆)或Sura(素罗)的意译，意为光明、自在、最胜。这是居于天界的一类众生，是六趣众生之 一，他们享受人间以上的胜妙果报。
龙，梵文Naga(那伽)的音译，是一类身长无足有鳞大力的众生。龙有神力能变化云雨，得一滴之水，可散六虚以为洪流，得少水可以降大雨。
夜叉，又译作药叉(Yaksa)，意译为勇健鬼，能鬼也能吃人伤人。其行动灵敏快捷，能飞腾空中，也能陆行。夜叉受持佛法，能成为佛的护法神，本经后面所讲的十二位药叉大将，都是夜叉。
乾达婆(Gandharva)，意为香神。这类众生以香为食，身体也能发出香气。诸天举行盛会时，由他们奏乐，是帝释的乐神之一。
阿修罗(Asuar)意为非天，亦称修罗，有天之福而无天之德，是一类好斗的天居众生，六道之一。其女子貌美，男子丑陋。
迦楼罗(Garuda)，意为金翅鸟。这类鸟很大，两翅相去三百三十六万里，能食龙，为佛的护法神之一。
紧那罗，亦作甄陀罗，意为“人非人”即似人而头上生角。从属于帝释，是八部中的歌神，女的多为乾达婆之妻。
摩目候罗伽(Mahoraga)意译为大蟒神，其形人身而蛇首，因多恚多妒，故受蛇首之报，也是帝释乐神之一。
[11]人非人等：指人与鬼神而言。
参与药师法会的学众既有各种各样的人，也有各部类非人众生，所以经文说：“人非人等，无量大众”。这些无量大众，恭敬地围绕着佛陀，听他宣说微妙的大法。
二、正宗分
(一)药师如来、十二大愿
尔时曼殊室利法王子，承佛威神从座而起，偏袒一肩，右膝着地。向薄伽梵，曲躬合掌，白言，世尊，惟愿演说如是相类诸佛名号，及本大愿殊胜功德，令诸闻者，业障消除，为欲利乐像法转时，诸有情故。
尔时世尊赞曼殊室利童子言：善哉!善哉!曼殊室利，汝以大悲，劝请我说诸佛名号，本愿功德。为拔业障所缠有情，利益安乐像法转时，诸有情故。汝今谛听，极善思惟，当为汝说。
曼殊室利言：唯然，愿说。我等乐闻，佛告曼殊室利，东方去此过十歹克伽沙等佛土，有世界名净琉璃，佛号药师琉璃光、如来、应、正等觉、明行圆满、善逝、世间解、无上士、调御丈夫、天人师、佛、薄伽梵。曼殊室利，彼世尊药师琉璃光如来，本行菩萨道时，发十二大愿，令诸有情，所求皆得。
第一大愿：愿我来世得阿耨多罗三藐三菩提时，自身光明炽然，照耀无量无数无边世界。以三十二大丈夫相，八十随形，庄严其身，令一切有情，如我无异。
第二大愿：愿我来世得菩提时身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明广大，功德巍巍，身善安住，焰网庄严，过于日月，幽冥众生，悉蒙开晓，随意所趣，作诸事业。
第三大愿：愿我来世得菩提时，以无量无边智慧方便，令诸有情，皆得无尽所受用物，莫令众生有所乏少。
第四大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中，若行声闻独觉乘者，皆以大乘而安立之。
第五大愿：愿我来世得菩提时，若有无量无边有情，于我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒，设有毁犯，闻我名已，还得清净，不堕恶趣。
第六大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，其身下劣，诸根不具，酉鬼陋顽愚，盲聋痖，挛辟背偻，白癞颠狂，种种病苦，闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦。
第七大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。我之名号，一经其耳，众病悉除，身心安乐，家属资具，悉皆丰足，乃至证得无上菩提。
第八大愿：愿我来世得菩提时，若有女人，为女百恶之所逼恼，极生厌离，愿舍女身，闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相，乃至证得无上菩提。
第九大愿：愿我来世得菩提时，令诸有情，出魔 网，解脱一切外道缠缚。若堕种种恶见稠林，皆当引摄置于正见，渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提。
第十大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，王法所录，绳缚鞭挞，系闭牢狱，或当刑戮，及余无量灾难陵辱，悲愁煎逼，身心受苦，若闻我名，以我福德威神力故，皆得解脱一切忧苦。
第十一大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，饥渴所恼，为求食故，造诸恶业。得闻我名，专念受持，我当先以上妙饮食饱足其身，后以法味，毕竟安乐而建立之。
第十二大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，贫无衣服，蚊虻寒热，昼夜逼恼。若闻我名，专念受持，如其所好，即得种种上妙衣服，亦得一切宝庄严具，华涂香，鼓乐众伎，随心所玩，皆令满足。
曼殊室利，是为彼世尊药师琉璃光如来，应正等觉，行菩萨道时所发十二微妙上愿。
尔时：那时。即大众环绕世尊而听法的时候。
曼殊室利：即文殊师利菩萨，过去早已成佛，名龙种上尊王佛。
法王子：此处指文殊师利菩萨。佛说：“我为法王，于法自在”。如同国王的太子，将来要继承王业的。所以称法王子。
偏袒一肩，右膝着地：比丘平时所披的袈裟，是将两肩盖覆着的，到了将要礼佛的时候，为表示对佛致以最高的敬意，特将右肩偏袒出来，亦即露出右臂，再行将右边膝盖靠着地面下跪，面向薄伽梵，弯着腰像鞠躬似的，并 且双手合掌。这是当时印度大众集合向佛请法时，所常用的一种隆重的礼节。这里曼殊室利菩萨为利益众生，向佛诚恳地请法，故依循此礼节而行。
世尊：音译“薄伽梵”或‘婆伽婆”。对释迦牟尼佛的尊称。因为佛具万德，为世人所尊重。故名。
业障：“业”是梵文Karma的意译，意思是“造作”，泛指一切行为、言语和思想。佛教认为众生原来都具有灵明、洞澈湛寂常恒的本性，但因妄想执着，以致起惑造业，轮回六道。此妄心障覆本性，也叫无明。“障”是障碍，业即我们现在此生或过去所作的一切行为。
像法转时：佛入灭千年后，为像法时代。以佛像供养，来弘扬佛法的时期，为一千年。
有情：也称众生，指有情识的生物，包括人和一切大小动物。
曼殊室利童子：即是文殊菩萨的化身。
[10]谛听：即仔细地、认真地听。
[11]唯然：即“是的”、“好的”的意思。
[12]歹克伽沙：梵文音译，意译为印度的恒河。歹克伽沙，即以恒河的沙(无量数)比喻数量之多的意思。
[13]净琉璃世界：指在我们这个世界的东边，距离十恒河沙远的地方。亦即药师如来所住的常寂光净土、清净法界。
[14]应：即应供。佛的十种名号之一。谓应受人天之供养，故名应供。
[15]正等觉：或称正遍觉。音译为三藐三菩陀，佛的十大名号之一。
[16]明行圆满：又名明行足。佛的十大名号之一。佛依戒定慧三明万行具足圆满而得阿耨多罗三菩提，故名明行足。
[17]善逝：佛的十大名号之一。谓如实去彼岸，不再退没生死之海。“逝”，即去的意思，也就是入涅。
[18]世间解：佛的十大名号之一。“解”是解了，对于世间事理，众生苦本、苦因以及灭苦的方法、离苦的究竟处，都明达了解，称为世间解。
[19]无上士：佛的十大名号之一。“士”即士大夫。佛于天上人间，唯我独尊，为人天的导师，故称无上士。
[20]调御丈夫：佛的十大名号之一。调御如驯马师，把暴躁的烈马驯练成驯服的良马。佛教化众生，无论众生的根性如何恶劣，如何刚强难制，都能善巧调御，使他慢慢转向佛法，修学佛法而得成就。
[21]天人师：佛的十大名号之一。佛出世间，不但教化人类，也同样教化天人，是天人的教师，故称天人师。
[22]菩萨道：即菩萨所修之道。菩萨修行圆满，自他二利，自未得度先度人者，名菩萨道。
[23]阿耨多罗三藐三菩提：意译无上正等正觉。
[24]自身光明：谓佛自身发出光明。像法华眉毛、华严的足光一样，药师如来有身光，能遍照一切世间，并愿一切众生也有身光。
[25]无量无数无边世界：形容世界之极为广大。
[26]三十二大丈夫相：简称三十二相。指佛的庄严仪表，有三十二个显著特征。
[27]八十随形：指身体某部位美好的仪容有八十种，释尊当时即因德相庄严，每次出游教化，还不曾说法，便有很多人要求皈依。
[28]身如琉璃：意谓身如青色宝琉璃一样，内外明澈，净无瑕秽。
[29]幽冥：原意是虽为有理，但幽远非常识所及之处。这里指三恶道中无真理之光处。
[30]无量无边智慧方便：无量是指智慧深湛，坚澈真如;无边是指智慧广大，横穷法界;智是证真，慧是达俗;度众生可以方便圆通，即随方应便。
[31]邪道：谓非理之行法。指除了如来的戒、定、慧为正觉道外，其如六师外道等都属于邪道。
[32]菩提道：即正觉道。意思是修持正觉的途径。
[33]声闻：即声闻乘。二乘或三乘之一。凡是闻听佛音声与修四谛法门而悟道的人，都称为声闻。
[34]独觉：又名缘觉、辟支佛。即缘觉乘。二乘或三乘之一。于佛在世时听佛说十二因缘之理而悟道者，名为缘觉。若生于无佛之世，观诸法生灭因缘而自行悟道者，名为独觉。
[35]大乘：音译摩诃衍那。摩诃即“大”的意思，“衍”即是“乘载”(如车、船)或“道路”的意思。是印度公元一世纪左右形成的佛教派别，亦称大乘佛教。
[36]梵行：谓梵天之行法，亦即断YIN欲而得清净之行法。又证得涅之万行，亦名梵行。
[37]缺戒：指所受的戒能够做到完全无犯，犯了所受的戒，就是有了缺漏。船漏了就不能渡过河，唯有戒行无缺，方能登佛地。
[38]三聚戒：大乘菩萨戒之一。即摄律仪戒(不作诸恶)，摄善法戒(行一切善)，饶益有情戒(利益众生)，三者总称三聚戒。
[39]恶趣：即地狱、饿鬼、畜生三恶趣。
[40]挛辟背偻：即跛足、驼背。
[41]黠慧：即世俗的聪明智慧。
[42]诸根完具：药师如来所发的第六愿。也有的解说称“诸根具足愿”。谓众生眼、耳、鼻、舌、身、意六根完全具足，没有任何缺陷。
[43]无上菩提：即佛菩提。
[44]转女成男：药师如来的第八大愿。只要闻听药师如来名号，一心称念，礼敬供养，就可转女成男。
[45]丈夫相：即勇健者之相。
[46]出魔 纲：“ ”同“绢”。即出离恶魔的绢。与纲的样子差不多，如果分别来说，捉兽的叫做绢，捕鱼的叫做纲。
[47]恶见稠林：恶见，就是邪见，也即不是正见。
[48]菩萨行：谓上求佛道，下化而生，即求自利利他、圆满佛果之菩萨大行，如布施等之六度即是。
[49]绳缚鞭挞、击闭牢狱：即用绳子系缚，用鞭子抽打，然后关闭到牢狱之中去。古代王法的刑罚制裁是很残酷的。
[50]刑戮：即判死刑被斩首。
[51]福德威神力：“福德”即一切善行所得之福利功德。“威神力”，即威势勇猛不要测度的神通之力。
[52]妙饮食：即美妙的饮食。谓对于衣食无着落的人群，为了不使因求衣、食而造罪，药师佛即以上妙饮食，饱足其身，解除他为饥渴所迫的苦恼。
[53]法味：即妙法之滋味。
[54]宝庄严具：即用珍宝庄严的饰具。
[55]华涂香：“华”，即以花结成环，用以装饰头或身。“涂香”，即以香涂于身手供养佛。
2、佛土庄严、皆七宝成。
复次曼殊室利!彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严。我若一劫，若一劫余，说不能尽。然彼佛土，一向清净无有女人，亦无恶趣，及苦音声。琉璃为地，金绳界道，城阙宫阁轩窗罗网，皆七宝成，亦如西方极乐世界。功德庄严，等无差别。于其国中，有二菩萨摩诃萨：一名日光遍照，二名月光遍照，是彼无量、无数菩萨众之上首次补佛处，悉能持彼世尊药师璃璃光如来、正法宝藏。是故曼殊室利，诸有信心善男子善女人等，应当愿生彼佛世界。
复次：再次，又一次的意思。
佛土：指一佛所住的国土或一佛所教化的国土。
劫：为梵文劫波的音译的简称。是指很长很长的时间，中国译为时分。极长的时间，印度叫劫波，简称为劫。一劫：世界的一“成”到一“毁”叫做一劫，劫有小、中、大三种：一个小劫为1680万年，(世上人的寿命有增减，从人寿十岁算起，每百年增加一岁，直到八万四千岁，再从此每百年减一岁，直减到十岁，如此增减时间总共为1680万年。)二十个小劫为一个中劫，八十个中劫合为一个大劫，一大劫包括“成、住、坏、空”四个时间，通称为四劫。
一向清净：意谓自始至终都是清净的。
金绳界道：即用金绳作为境界、道路。
城阙宫阁、轩窗罗纲“城”，即城垣。“阙”是城门上的楼屋。“宫”是高深广大的宫殿。“阁”是楼阁，即宫内之楼。“轩”是屋上的飞檐，远有屋檐间的横室也叫轩，类似于今日的阳台改成有窗的小屋。“罗纲”，是金银丝、珍宝丝结成的网，可以覆盖在宫殿楼阁的屋顶上，显得更为庄严。这都是形容东方琉璃世界的美妙庄业。
七宝：即金、银、琉璃、珊瑚、琥珀、砗磲、玛瑙等七种珍宝。
西方极乐世界：亦称西方净土。即阿弥陀佛之极乐净土。
日光遍照：菩萨名。日光破暗以照尽，比喻这位菩萨的威力，周遍法界，胜过一切，为药师左侍。
[10]月光遍照：菩萨名。月光清凉以照夜，比喻这位菩萨的威力和日光菩萨一样，周遍法界，胜过一切，为药师佛右侍。
[11]次补佛处：即依次延补佛的处所。凡菩萨修行到最高位即等觉位，称一生补处处，渐近佛位，将依次处补佛位而成佛。
[12]正法宝藏：“藏”的原意是库藏，一切钱财珍宝，不用时可以放进去，要用时就拿出来名为藏。一切清净微妙的功德法财，也都从此正法而流出，一切无边的功德法门，也都含藏于此，所以名为正法宝藏。
[13]善男子、善女人：是指闻佛法而信受的男女。此处统称缁素，即在家、出家的二众，所有修持佛法者。凡和六道中有缘的众生都可称为善男子、善女人。
3、因果定律、学持净戒
尔时世尊复告曼殊室利童子言，曼殊室利：有诸众生，不识善恶，惟怀贪吝，不知布施，及施果报，愚痴无智，阙于信根，多聚财宝，勤加守护，见乞者来，其心不喜，设不获已而行施时，如割身肉，深生痛惜。复有无量悭贪有情，积集资财，于其自身、尚不受用，何况能与父母妻子、奴婢、作使、及来乞者，彼诸有情，从此命终，生饿鬼界、或傍生趣，由昔人间，曾得暂闻药师琉璃光如来名故。今在恶趣，暂得忆念彼如来名，即於念时，从彼处没，还生人中，得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者。一切所有，悉无贪惜。渐次尚能以头目、手足、血肉、身分、施来求者，况余财物。
复次，曼殊室利：若诸有情，虽於如来受诸学处，而破尸罗。有虽不破尸罗，而破轨则，有於尸罗、轨则、虽得不坏，然毁正见。有虽不毁正见，而弃多闻，於佛所说契经深义、不能解了。有虽多闻，而增上慢，由增上慢覆蔽心故。自是非他。嫌谤正法，为魔伴党。如是愚人，自行邪见，复令无量俱胝有情、堕大险坑。此诸有情，应於地狱、傍生、鬼趣、流转无穷。若得闻此药师琉璃光如来名号，便舍恶行，修诸善法，不堕恶趣。设有不能舍诸恶行、修行善法，堕恶趣者。以彼如来本愿威力，令其现前暂闻名号，从彼命终、还生人趣，得正见精进，善调意乐。便能舍家，趣於非家，如来法中，受持学处，无有毁犯，正见多闻，解甚深义，离增上慢，不谤正法，不为魔伴，渐次修行诸菩萨行，速得圆满。
不识善恶：这不是指白痴、天生的呆子，而是指那些否认善恶抹煞因果、抹煞道德观念的人。他们不肯行善，专做恶事。
贪吝：即贪著、吝啬的意思。
阙于信根：意思是不信佛法的基本义理，缺少信奉佛法的根本基础。
饿鬼界：即饿鬼趣或饿鬼道。
傍生趣：即畜生趣。意谓畜生是傍行之生类。
宿命念：“宿命”，即宿世之生命。“宿命念”，与宿命通含义相仿，意谓能知宿世之生命。
血肉身分施来求者：即以自己的血肉之身分别施舍于人。
诸学处：谓七种所学之处，即自利、利他、真实义、力、成熟众生、自熟佛法、无上菩提。此处则指学戒之处。
破尸罗：是持戒修行中的愚人邪见之一，“尸罗”意译为“性善”，引伸为戒律。毁坏根本重戒称“破尸罗”。
[10]破轨则：持戒修行中的愚人邪见这一。即是违犯戒律、不守轨则的人。
[11]毁正见：持戒修行中的愚人邪见之一。即是对佛之说法加以否定或歪曲。
[12]弃多闻：持戒修行中的愚人邪见之一。即是向小背大，强调片面，不能圆融的见解。
[13]增上慢：持戒修行中的愚人邪见之一。就是抬高自己，妄自傲慢，未得智慧自己说已经得到了，未证佛果说已经证得了。
[14]嫌谤正法：持戒修行中的愚人邪见之一。即是恶意毁谤佛法，甚至诃佛骂祖，毁教排禅。
[15]俱胝：意译为亿。乃印度数量之名。中国常作千万、亿解，亦有说为十万、百万、千万的，都是代表极大的数目。
[16]正见精进、善调意乐：“正见”，指深信佛法。“精进”，指修善断恶、去染转净;善调意乐，指自己心中制恶持戒学佛，身心清净、法喜充满和愉快。
[17]如来法：即出世间法，指佛陀所说的教法，亦即佛法，内容为佛教三藏经典。
[18]速得圆满：指超直人修证了义，很快得到圆满。
4、业因果报、往生觉岸
复次、曼殊室利，若诸有情，悭贪嫉妒，自赞毁他，当堕三恶趣中，无量千岁、受诸剧苦。受剧苦已，从彼命终，来生人间，作牛马驼驴，恒被鞭挞、饥渴逼恼，又常负重、随路而行。或得为人，生居下贱，作人奴婢，受他驱役，恒不自在。若昔人中、曾闻世尊药师琉璃光如来名号，由此善因，今复忆念，至心归依，以佛神力，众苦解脱，诸根聪利，智慧多闻，恒求胜法，常遇善友，永断魔 ，破无明壳，竭烦恼河，解脱一切生老病死、忧愁苦恼。
复次曼殊室利，若诸有情，好喜乖离，更相斗讼，恼乱自他，以身语意、造作增 长种种恶业，展转常为不饶益事，互相谋害。告召山林树土冢等神，杀诸众生，取其血肉，祭祀药叉罗刹婆等。尽怨人名，作其形像，以恶咒术、而咒诅之，厌魅蛊道。咒起死鬼，令断彼命、及坏其身。是诸有情，若得闻此药师琉璃光如来名号，彼诸恶事、悉不能害。一切展转皆起慈心，利益安乐，无损恼意、及嫌恨心，各各欢悦，於自所受、生於喜足，不相侵陵，互为饶益。
复次、曼殊室利，若有四众、比丘、比丘尼、邬波索迦，邬波斯迦及馀净信善男子、善女人等，有能受持八分斋戒，或经一年，或复三月，受持学处，以此善根，愿生西方极乐世界无量寿佛所，听闻正法，而未定者。若闻世尊药师琉璃光如来名号，临命终时，有八大菩萨，其名曰文殊师利菩萨、观世音菩萨、得大势菩萨、无尽意菩萨、宝檀华菩萨、药王菩萨、药上菩萨、弥勒菩萨、是八大菩萨，乘空而来，示其道路，即於彼界种种杂色众宝华中、自然化生。或有因此生於天上。虽生天上，而本善根亦未穷尽，不复更生诸馀恶趣。天上寿尽，还生人间，或为轮王，统摄四洲，威德自在，安立无量百千有情於十善道。或生刹帝利、婆罗门、居士、大家，多饶财宝，仓库盈溢。形相端正，眷属具足，聪明智慧，勇健威猛、如大力士，若是女人、得闻世尊药师琉璃光如来名号，至心受持，於后不复更受女身。
悭贪嫉妒：“悭”，即惜己物是悭，恋求他物是“贪”，《成实论》说“悭有五种：财悭、法悭、家悭、处悭、赞悭。”害贤为“嫉”，忌善为“妒”。这些都是恶业，都有各自的恶报。其中悭贪是身恶业，嫉妒是意恶业，自赞毁他是口恶业。
不自在：即不能进退无碍、自由自在。
至心皈依：皈是皈投，依是依靠。意为以至诚恳切之心，把身心性命皈依佛陀。
魔：魔是魔王，贪欲为业。以八万四千尘劳，纲罗众生，叫做魔 ，意为罗网。
无明壳殳：壳即是卵壳殳。无明壳殳，是一种比喻，如小鸡在未孵出之时，闭在蛋壳内，是黑暗、闭塞而不自由的。无明即是愚痴，是生死烦恼的根本。众生在无明烦恼的蒙蔽中，愚痴暗昧，不得解脱自在，也如小鸡在蛋壳里一样，所以叫做无明壳殳。
烦恼河：人的妄心不断流注，欲念一个接着一个，如同滔滔河流里的波浪，此起彼落，此落彼起，没有休止，使得人在生老病死中受尽烦恼苦楚，这就叫做烦恼河。
乖离：乖，即乖僻，远背常理;离，即离间。乖离是指与人格不入，欢喜找别人岔子的人。属于真恶意业。
斗讼：斗是殴门，争吵打架，属身业;讼是指打官司，《易经》说：“讼则凶”。属嗔恶的口业。
告召：祷告、召请的意思。与下面所讲的祭祀、咒咀、厌祷、虫事、起尸等为同一含义，是相对上文的乖离斗讼而说的，都是用秘密方法，邪魔外道伤害他人的恶果。
[10]厌魅蛊道：“厌魅”，指以咒语咒死，使其杀害怨敌。“蛊道”，蛊为一种由人工培养的毒虫，能害人致死。用毒虫偷偷放入仇人的衣服或食物中以毒害人，即名蛊道。
[11]八分斋戒：亦称八关斋戒、八斋戒、简称八戒。指佛教为在家的男女教徒制定的八条戒条。即不杀、不盗、不邪YIN、不妄语、不饮酒、不眠坐高广大床、不装饰打扮、不视听歌舞、不非时食(即过午不食，只吃早中二餐)o前七项是戒，后一项是斋，合称为八分斋戒。此戒有的常年受持，有的在一年中的正月、五月、九月三个月内受持。
[12]八大菩萨：指位居等觉、已近佛位的大菩萨。其名称下面经文中已有。
[13]宝华：指佛界的莲花。该莲花有色有香，光明净妙，又能结果，故称宝华。
[14]天上：泛指欲界之六欲天和色界、无色界诸天。六欲天为四天王天、忉利天、夜魔天、兜率天、乐变化天、他化自在天;色界有十八天，无色界有四天。从佛法来说，生于天上还不是根本解脱。因为天神也有寿命终时，还有可能坠落人间。只有往生西方净土和东方琉璃世界才是最终目标，才能根本解脱生死。
[15]轮王：指世间的转轮圣王，为第一有福之人。于人寿八万四千岁时出现，统辖四天下。转轮王出现时，天下太平，人民安乐，没有天灾和人祸。
[16]四洲：即南瞻部洲、东胜神洲、西牛货洲、北俱虞洲。
[17]十善道：亦称十善业。即不杀生、不偷盗、不邪YIN(三身业)、不妄言、不两舌、不绮语、不恶口(四口业)、不贪欲、不嗔恚、不邪见(三意业)。
[18]刹帝利、婆罗门：古印度社会四种种姓阶级中的二种。婆罗门被称为“人间之神”，是古印度一切知识垄断者：刹帝利为印度掌握军政的国王和武士。
5、演说真言、诸佛护念。
复次、曼殊室利：彼药师琉璃光如来得菩提时，由本愿力，观诸有情、遇众病苦，瘦挛、乾消、黄热等病，或被厌魅蛊毒所中，或复短命，或时横死，欲令是等病苦消除，所求愿满。时彼世尊入三摩地，名曰除灭一切众生苦恼。既入定已，於肉髻中、出大光明，光中演说大陀罗尼曰。
南无薄伽伐帝、革卑杀社窭噜、薜琉璃钵喇婆、喝口罗也，怛他揭多耶、阿口罗诃帝、三藐三勃陀耶女至怛他、革卑杀逝、革卑杀逝、革卑杀社、三没揭帝莎诃。
尔时光中说此咒已，大地震动，放大光明，一切众生、病苦皆除，受安隐乐。曼殊室利，若见男子女人、有病苦者，应当一心为彼病人、常清净澡漱，或食或药或无虫水，咒一百八遍，与彼服食，所有病苦，悉皆消灭。若有所求，至心念诵，皆得如是、无病延年。命终之后，生彼世界得不退转、乃至菩提。是故曼殊室利，若有男子女人，於彼药师琉璃光如来、至心殷重、恭敬供养者，常持此咒勿令废忘。
复次、曼殊室利：若有净信男子女人，得闻药师琉璃光如来、应、正等觉、所有名号，闻已诵持。晨嚼齿木，澡漱清净，以诸香华、烧香涂香，作众伎乐，供养形像。於此经典，若自书，若教人书，一心受持，听闻其义，於彼法师，应修供养，一切所有资身之具，悉皆施与，勿令乏少。如是便蒙诸佛护念，所求愿满乃至菩提。
瘦挛乾消黄热等病：“瘦挛”，指足拘缩弯曲;“乾消”即是消渴，现代医学称为糖尿病;“黄热”指黄疸型肿胀症和热性传染病，这些都是病苦。
魇魅虫毒：与前面所讲的“鬼虫道”含义相同。
横死：指寿命未尽，无病不该死亡，但突然遭遇横祸而死。
三摩地：也称三昧，意译为正定。又译“等持”，即持心平等，不昏沉，不掉举，专心保持平衡，安定、而专 注于一境。佛经中说，佛将说法、说咒或现神通时，每每先入定。其实佛无时不在定境之中，无论起居、衣食、行走、说法度生，佛的心境都已安住在定中。一切功德智慧，确都由定中流出。现在药师如来所入的三摩地，名称叫做“除灭一切众生苦恼定”。
於肉髻中是出大光明：头顶上的肉髻，为佛的三十二相之一，名无见顶相、放大光明。
大陀罗尼：译为总持。梵文陀罗尼即是咒，又名“真言”。总持即是总摄一切法，持无量义。
南无：是皈依、皈命的意思，“南无”是梵文音译，一般念作“那摩”，表示对佛、法、僧三宝的尊敬和虔信。
薄伽伐帝：为薄伽梵的异译，即世尊。
革卑杀社窭噜：“革卑杀社”的意思是药;“窭噜”的意思是师，合译为药师。
[10]薜琉璃：即是琉璃。
[11]钵喇婆：即指光。
[12]喝口罗也：意是王。
[13]怛他揭多耶：意是如来。
[14]阿口罗喝帝：意是应(供)。
[15]三藐三勃陀耶：意是等正觉。此句与上几句连起的意思是：“皈命药师琉璃光如来、应、正等觉”。
[16]怛侄他：是“即说咒曰”的意思。
[17]：应读作“嗡”音。意义很多，一皈依义，即是集中身心皈向三宝;是警觉义，提起注意的意思，即把精神集中起来，注意一个地方。
[18]革卑杀逝：意思是药。
[19]革卑杀社：含意与革卑杀逝同，意谓陈弃的药。
[20]三没揭谛：意为普度，即普遍救度世界一切众生之意。
[21]莎诃：也作娑婆诃。意思是速得成就。
[22]无虫水：即无虫的洁净之水。
[23]咒一百八遍：烦恼有一百零八种，所以特地用一百零八遍的咒力破除一百零八种烦恼。
[24]得不退转：不退转，指所修之功德善根愈增愈进，不更退失转变。
[25]齿木：古代印度人习惯于清晨起身，就嚼一种大约手指粗的树枝木条，叫做“齿木”，木中有苦汁，可除口臭。这里是讲恭敬供食药师琉璃佛，必须清净身和口。
[26]供养形像：指以香花、灯明、饮食、资财等物供奉三宝，香花表示万行，烧香表示智观，涂香表示戒品，伎表示四摄(布施、爱语、利行、同事)。
[27]法师：指通晓佛法，又能引导众生信受奉行佛法的人。
6、恭敬佛陀、流传经宝。
尔时曼殊室利童子白佛言：世尊!我当誓於像法转时，以种种方便，令诸净信善男子、善女人等，得闻世尊药师琉璃光如来名号，乃至睡中、亦以佛名觉悟其耳。世尊：若於此经受持读诵，或复为他演说开示，若自书，若教人书，恭敬尊重，以种种华香、涂香、末香、烧香，华曼璎珞，幡盖伎乐，而为供养，以五色采、作囊盛之，扫洒净处，敷设高座、而用安处。
亦以佛名觉悟其耳：意即修行人在睡梦中亦能闻佛名号而得到觉悟。
受持读诵：即领受、忆持、阅读、背诵。分别来讲，即信力领纳叫受;念力坚持叫持;对着经文看着念叫读;不看经文，凭记忆而背出来叫诵。
开示：“开”为开发之意，即破除众生之无明，开如来藏，见实相之理。“示”为显示之意，谓惑障既除，则知见体显，法界万德显示分明，意即佛菩萨以佛教道理晓喻修行者。
末香：犹如现在所烧的檀香粉，古印度则是将檀香粉直洒在佛菩萨身上。
烧香：犹如现在线香，一枝一枝的。或盘香，一盘圈成好几圈。
璎珞：系用各种珠宝贯串起来的装饰品。
幡盖：指幢幡和宝盖。悬挂在佛菩萨像前长竿，竿柱高秀，头安宝珠，以种种彩帛装饰之，种为幢;长帛下坠者，称为幡;以宝玉装饰起来悬挂于菩萨所坐的高座上的伞盖，称为宝盖，幢幡则表示禅定。
伎乐：指用琵琶、铜钹、琴、瑟、箜篌等乐器所演奏的音乐，又歌颂赞唱佛德的佛赞，也称伎乐。
五色采作囊盛之：即用五种不同色织成采缎作成经囊，作盛放《药师经》和《药师神咒》之用。是为恭敬尊重之意。
[10]敷设高座：即设置高座，用以安放经典。
7、四大天王、供养守护。
尔时四大天王、与其眷属、及馀无量百千天众，皆诣其所，供养守护。世尊：若此经宝流行之处，有能受持，以彼世尊药师琉璃光如来本愿功德、及闻名号，当知是处无复横死，亦复不为诸恶鬼神夺其精气。设已夺者，还得如故，身心安乐。
四大天王：也称护世四天王。古代南亚次大陆的神话传说，后为佛教所沿用。称须弥山腹有四天王天。四天王天是四大天王和其眷属居住之处。须弥山的山腰有一小山，名犍陀罗山，山有四个山峰，各有一天王居住，各护一天下。中国民间欲称其为四大金刚。寺院的天王殿塑有四大天王像。东方持国天王塑像白色，怀抱琵琶;南方增长天王身青色，手持宝剑;西方广目天王身红色，右掌托宝塔，左手缠绕一条龙;北方多闻天王身绿色，右手持伞，左手握银貂。他们手中的法器都是吉祥的意义，宝剑舞动生风，琵琶协音可调，宝伞可以挡雨，龙被降服变顺，四方合起来就是风调雨顺，以保国泰民安。
经宝：意即此经为法宝。此经宝最为吉祥，所以不会有横死，及诸恶鬼神夺其精气等许多灾患。
8、诵思经典、一切皆遂
佛告曼殊室利：如是如是，如汝所说。曼殊室利：若有净信善男子善女人等，欲供养彼世尊药师琉璃光如来者，应先造立彼佛形像，敷清净座、而安处之。散种种华，烧种种香，以种种幢幡、庄严其处。七日七夜、受八分斋戒，食清净食，澡浴香洁，著清净衣，应生无垢浊心、无怒害心，於一切有情、起利益安乐、慈悲喜舍、平等之心。鼓乐歌赞，右绕佛像。复应念彼如来本愿功德，读诵此经、思惟其义，演说开示，随听乐求，一切皆遂，求长寿得长寿，求富饶得富饶，求官位得官位，求男女得男女。若复有人、忽得恶梦见诸恶相，或怪鸟来集，或於住处，百怪出现。此人若以众妙资具、恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来者，恶梦恶相、诸不吉祥、皆悉隐没，不能为患。或有水火，刀毒悬险，恶象师子，虎狼熊罴毒蛇恶蝎，蜈蚣蚰蜒，蚊虫等怖，若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏、皆得解脱。若他国侵扰，盗贼反乱，忆念恭敬彼如来者，亦皆解脱。复次、曼殊室利，若有净信善男子善女人等，乃至尽形不事除天，惟当一心归佛法僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩萨四百戒、比丘二百五十戒、比丘尼五百戒。於所受中、或有毁犯，怖堕恶趣。若能专念彼佛名号、恭敬供养者，必定不受三恶趣生。或有女人、临当产时，受於极苦，若能至心称名礼赞、恭敬供养彼如来者，众苦皆除。所生之子，身分具足，形色端正，见者欢喜，利根聪明，安隐少病，无有非人夺其精气。
食清净食：即受用各种饮食，都得如法清净，绝对不可沾染五荤及鱼肉等。还有，既受八分斋戒，晚上就不能吃任何食物，如果过午还吃什么食物，即名为叫不清净食。
无垢浊心、无怒害心：垢浊心即垢心和浊心。垢心即是贪心;浊心即是痴心。怒害心是嗔心。贪嗔痴是烦恼中的三毒，也是佛门三忌。这里是讲没有贪、、痴三毒之心。
慈悲喜舍：即四无量心。慈是予人以快乐之心，悲是拨人痛苦之心，喜是见人离苦得乐而生庆悦之心，舍是舍弃一切，对任何人都无憎无爱，一视同仁，平等对待之心。
恶蝎：尾部有毒钩刺，有剧毒，可刺人使之中毒，故称恶蝎。
蚰蜒：生活在潮湿阴暗处，欲称草鞋虫、蓑衣虫，与蜈蚣同类。体短而微扁，灰白色。全身分十五节，每节有细长的足一对，最后一对特长，足易脱落，触角长，毒颚很大。
虻：状如绳，略大。专咬牲畜，也要叮人，有牛虻、花虻、食虫的区别。
不事馀天：即不事奉其馀诸天。就是不事奉外道天、魔王天和凡夫天，认为只有皈依三宝，依教修行，才能达到无漏的无馀涅磐。
禁戒：亦称净戒。“禁”是禁止身、口、意三恶业，“戒”是戒诸恶行。
形色：即形体与色相。如人有长短、方圆、高下、正不正等形相，可见于眼者。
利根：卽鋭利的根性。意谓眼、耳、
非人：指天龙八部、夜叉、恶鬼等等。
夺其精气：即夺去人的性命。
9、颂扬世尊、佛理教义
尔时，世尊告阿难言，如我称扬彼世尊药师琉璃光如来所有功德，此是诸佛甚深行处，难可解了、汝为信不。阿难白言，大德世尊，我於如来所说契经，不生疑惑。所以者何。一切如来，身语意业、无不清净。世尊，此日月轮、可令堕落，妙高山王、可使倾动，诸佛所言，无有异也。世尊，有诸众生，信根不具，闻说诸佛甚深行处，作是思惟，云何但念药师琉璃光如来一佛名号，便获尔所功德胜利。由此不信，返生诽谤，彼於长夜、失大利乐，堕诸恶趣，流转无穷。佛告阿难，是诸有情，若闻世尊药师琉璃光如来名号，至心受持不生疑惑，堕恶趣者，无有是处。阿难，此是诸佛甚深所行，难可信解，汝今能受，当知皆是如来威力。阿难：一切声闻、独觉、及未登地诸菩萨等，皆悉不能如实信解，惟除一生所系菩萨。阿难：人身难得，於三宝中、信敬尊重，亦难可得。闻世尊药师琉璃光如来名号，复难於是。阿难：彼药师琉璃光如来、无量菩萨行、无量善巧方便、无量广大愿，我若一劫、若一劫馀、而广说者，劫可速尽，彼佛行愿善巧方便、无有尽也。
大德：系对自觉、觉他、觉行圆满的三觉圆满者和万德具全者的尊称。佛具三觉：即本觉(一切众生本来具有的自性清净心)、始觉(外缘助薰开始觉知本有的自性)、究竟觉(发心修行，达到惑尽智圆证成佛道的究竟清净)。故称佛为大德世尊。而对菩萨、阿罗汉，有时也称大德。
契经：谓契理契机之经典。即指佛教经典。
日月轮：即日转和月轮。日轮即日宫，是日天子所居之宫殿，一般称太阳。月轮即月宫，是月天子所居之宫殿，一般称月亮。
妙高山王：指佛经上所说的须弥山。其山高大无比，为众山之王，故称为妙高王。
信根：五根之一。指信三宝、四谛。是对佛法信仰的基础或对佛法信仰的根本。
长夜：谓凡夫流转生死，无明昏暗，犹如长夜。
未登地诸菩萨：指尚未登十地位的一切菩萨。菩萨行共有五十一阶果位，由浅入深。即十信位、十住位、十行位、十回向位、十地伴及等觉菩萨位，合为五十一果位。其中十住、十行、十回向的三阶位称为三贤位。因尚未登十地、未入圣位，故称为未登地菩萨。
一生所系菩萨：即一生补处菩萨，亦称等觉菩萨。大乘阶位五十一位中最后一位之菩萨称等觉，因为是即佛位的一位补处大菩萨，是系属于一生补处的，故称一生所系菩萨。
10、皈依三宝、免堕六道。
尔时众中有一菩萨摩诃萨，名曰救脱，即从座起偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌、而白佛言：大德世尊，像法转时，有诸众生、为种种患之所困厄，长病赢瘦，不能饮食，喉唇乾燥，见诸方暗，死相现前，父母亲属，朋友知识，涕泣围绕。然彼自身卧在本处，见琰魔使、引其神识至於琰魔法王之前。然诸有情、有俱生神 。随其所作，若罪若福，皆具书之，尽持授与琰魔法王。尔时彼王推问其人，计算所作，随其罪福、而处断之。时彼病人，亲属知识，若能为彼皈依世尊药师琉璃光如来，请诸众僧转读此经，然七层之灯，悬五色续命神幡。或有是处、彼识得还，如在梦中，明了自见。或经七日、或二十一日、或三十五日、或四十九日，彼识还时，如从梦觉，皆自忆知善不善业、所得果报。由自证见业果报故，乃至命难、亦不造作诸恶之业。是故净信善男子、善女人等，皆应受持药师琉璃光如来名号，随力所能，恭敬供养。
尔时阿难问救脱菩萨曰，善男子，应云何恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来，续命幡灯、复云何造。救脱菩萨言，大德，若有病人、欲脱病若，当为其人、七日七夜受持八分斋戒。应以饮食、及馀资具，随力所办、供养比丘僧。昼夜六时、礼拜供养彼世尊药师琉璃光如来，读诵此经四十九遍，燃四十九灯，造彼如来形像七躯，一一像前、各置七灯，一一灯量、大如车轮，乃至四十九日光明不绝。造五色采幡，长四十九搩手，应放杂类众生、至四十九。可得过度危厄之难，不为诸横恶鬼所持。
救脱：菩萨名。此菩萨以救人病苦、脱离灾难而得名。身呈红色，坐莲花座，右手执持妙法藏供养，左拳按胯。
死相：即人临死时显示出来的种种外相，如瞳孔散大，体温渐降，呼吸缓慢，只呼不吸，心跳微弱，脉象似停，人气将断，神识欲去。
琰魔使：“琰魔”即琰魔法王，又名阎摩王，即民间俗称的阎罗王。是冥界之王，对善恶赏罚、祸福升降法中有操纵权，故名法王。“琰魔使”，即琰魔法王的使卒，欲称鬼差、无常等等，又叫勾魂使，名目繁多。
神识：即一般世间所说之灵魂。
俱生神：即与生俱来的神。佛经载，此神常骑在人之双肩，在人死后即向阎摩王报告该人之出生与善恶。有男女二神：女神名同生，通常坐于人之右肩，记录该人所作之恶事;男神名同名，通常坐于人之左肩，记录该人所作之善事。
七层之灯：为对治身三口四之七支恶业而燃点之七层智慧明灯。恶业有七支，身三(杀生、偷盗、邪YIN)，口四(妄语、绮语、两舌、恶口)。七层智慧明灯照出七菩提路，以防止七恶业，故称七层之灯。
五色续命神幡：“续命神幡”，又作“寿命幡”。乃延寿祈命之神幡。此幡有五种颜色，即青、黄、赤、白、黑，故名五色续命神幡。
六时：古印度将一日一夜分为昼三时和夜三时，合计六时。昼三时为早晨、中日、日没;夜三时为初夜、中夜、后夜。
搩手：亦称磔手。(音哲)手，即张开手指，从大拇指端到中指端的距离叫一搩手。中国欲称“一虎口”。古代印度多以搩手量物，中国民间木工也有用此以估计长度的。
放杂类众生：即佛教所说的放生。“杂类”指家禽、家畜、水族、爬虫之类。放生就是解脱这些生物的灾难，使之延长生命，由此可获得消灾延寿的功德。
诸横：谓一切横死的简称。横死指非因往世之业果致死，而系遭受意外灾祸而死亡的。如得病无医、王法诛戮、非人(恶鬼、夜叉等)夺精气、火焚、水溺、恶兽啖、坠崖、毒药咒诅、饥渴所困等，均属于横死。现代的车祸、飞机失事等，也属于横死。
11、国泰民安、无病欢乐。
复次、阿难，若刹帝利、灌顶王等、灾难起时，所谓人众疾疫难，他国侵逼难，自界判逆难，星宿变怪难，日月薄蚀难，非时风雨难，过时不雨难。彼刹帝利灌顶王等，尔时应於一切有情起慈悲心，赦诸系闭，依前所说供养之法、供养彼世尊药师琉璃光如来。由此善根、及彼如来本愿力故，令其国界、即得安隐，风雨顺时，谷稼成熟，一切有情，无病欢乐，於其国中，无有暴恶，药叉等神、恼有情者，一切恶相、皆即隐没。而刹帝利灌顶王等，寿命色力，无病自在，皆得增益。阿难，若帝后妃主，储君王子，大臣辅相，中宫采女，百官黎庶，为病所苦，及馀厄难，亦应造立五色神幡，然灯续明，放诸生命，散杂色华，烧众名香，病得除愈，众难解脱。
刹帝利：古印度四姓阶级之一，四姓阶级为婆罗门、刹帝利、吠舍、首陀罗。刹帝利是掌握军政的国王和武士阶级。
灌顶王：古印度国王的太子在即位时，由国师取四大海之水盛金瓶中，灌洒太子头顶，表示祝福。此为印度帝王即位的仪式，灌项以后就称灌顶王。
星宿：星官名。二十八宿之一，朱鸟七宿的第四宿。有星七颗，故早期亦称“七星”。这里指星象。
储君：即王储，太子。
黎庶：即平民百姓。
12、免遭横死、药叉护法
尔时，阿难问救脱菩萨言，善男子，云何已尽之命、而可增益。救脱菩萨言，大德、汝岂不闻如来说、有九横死耶，是故劝造续命幡灯，修诸福德，以修福故，尽其寿命、不经苦患。阿难问言：九横云何。救脱菩萨言，若诸有情，得病虽轻，然无医药、及看病者，设复遇医授以非药，实不应死、而便横死。又信世间邪魔外道妖孽之师，妄说祸福，便生恐动，心不自正，卜问觅祸，杀种种众生、解奏神明，呼诸魍魉，请乞福佑，欲冀延年，终不能得，愚痴迷惑，信邪倒见，遂令横死，入於地狱，无有出期，是名初横。二者、横被王法之所诛戮。三者、畋猎嬉戏，耽YIN嗜酒，放逸无度，横为非人夺其精气。四者、横为火焚。五者、横为水溺。六者、横为种种恶兽所啖。七者、横堕山崖。八者、横为毒药，厌祷咒诅、起死鬼等之所中害。九者、饥渴所困，不得饮食，而便横死。是为如来略说横死、有此九种。其余复有无量诸横，难可具说。复次，阿难彼琰魔王，主领世间名籍之记，若诸有情、不孝五逆，破辱三宝，坏君臣法，毁於性戒，琰魔法王、随罪轻重考而罚之。是故我今劝诸有情，然灯造幡。放生修福，令度苦厄，不遭众难。尔时众中有十二药叉大将。俱在会座，所谓
宫毗罗大将 伐折罗大将 迷企罗大将
安底罗大将 额你罗大将 珊底罗大将
因达罗大将 波夷罗大将 摩虎罗大将
真达罗大将 招杜罗大将 毗羯罗大将
此十二药叉大将，一一各有七千药叉、以为眷属。同时举声白佛言：世尊!我等今者蒙佛威力。得闻世尊药师琉璃光如来名号，不复更有恶趣之怖。我等相率、皆同一心，乃至尽形、归佛法僧，誓当荷负一切有情，为作义利，饶益安乐。随於何等村城国邑、空闻林中，若有流布此经，或复受持药师琉璃光如来名号，恭敬供养者，我等眷属、卫护是人，皆使解脱一切苦难，诸有愿求，悉令满足。或有疾厄、求度脱者，亦应读诵此经，以五色缕结我名字，得如愿已，然后解结。
尔时世尊赞诸药叉大将言，善哉善哉，大药叉将，汝等念报世尊药师琉璃光如来恩德者，常应如是利益安乐一切有情。
初横：指第一种横死。即生了病本来可以医治好，不当死而死亡的;信世间邪魔外道、妖孽之师妄说祸福等而横死，入于地狱，无有出期的。
五逆：即杀父、杀母、杀比丘、杀阿黎、破和合僧(破坏僧团)。
十二药叉大将：药叉名夜叉、阅叉、夜乞叉等。意译“勇健”、“轻捷”、“捷疾鬼”等。药叉多住天上，或深山窍谷，或偏僻海岛，游离虚空，行迹不定。夜叉受四天王中的毗沙门天王统领。夜叉有善有恶，有的以威势恼害人，有的则守护正法。十二“药叉大将”，即药叉中的大将。本经中十二位药叉大将都是誓言卫护《药师经》之受持者的善药叉。
宫毗罗：又作金毗罗，意译为极畏。身呈黄色，手持宝杵。
伐折罗：又作跋折罗，和耆罗，意译金刚。身呈白色，手持宝剑。
迷企罗：又作弥去罗，意译为执严。身呈黄色，手执宝棒或独钴。
安底罗：又作额你罗、安奈罗、安陀罗，意译为执星。身呈绿色，手持宝珠。
额你罗：又作额尔罗、末尔罗、摩尼罗，意译为执风。身呈红色，手持宝叉或矢。
珊底罗：又作娑你罗、素蓝罗，意译为居处。身呈烟色，手持宝剑或螺贝。
因达罗：又作因陀罗，意译为执力。身呈红色，手持宝棍。
波夷罗：又作婆耶罗，意译为执饮。身呈红色，手持弓矢。
摩虎罗：又作薄呼罗、摩休罗，意译为执言。身呈白色，手持宝斧。
真达罗：又作真持罗，意译为执想。身呈黄色，手持绢索或宝棒。
招杜罗：又作朱杜罗、照头罗，意译为执动。身呈青色，手持宝锤。
毗羯罗：又作毗伽罗，意译为圆作。身呈红色，手执宝轮或三钴。
七千药叉：为十二药叉大将的部下眷属。每一位药叉大将的部下各有七千药叉，合计为八万四千药叉。八万四千药叉，是用以对付八万四千尘劳的。
五色缕结我名字：五色缕，亦作五色线、五色绳、五色铤。系用青、黄、赤、白、黑五色之线系为一根线楼。“结我名字”，即结十二药叉大将的名字。这有两种说法：一说为用五色系丝线结十二药叉大将名字;另一说为称念一位药叉大将的名字就用五色丝线打一个结，如次称念十二药叉大将，打十二个结。
第三部分 流通分
尔时，阿难白佛言，世尊，当何名此法门，我等云何奉持。佛告阿难，此法门名说药师琉璃光如来本愿功德。亦名说十二神将饶益有情结愿神咒，亦名拔除一切业障。应如是持。时薄伽梵说是语已，诸菩萨摩诃萨，及大声闻、国王、大臣、婆罗门、居士、天、龙、药叉、健达缚、阿素洛、揭路荼、紧捺洛莫呼落伽、人非人等、一切大众闻佛所说，皆大欢喜，信受奉行。
法门：即佛所说的法。谓佛所说言语，为世之则，称为法。此法为众圣超凡入圣之门户，故称门。这里是指释迦牟尼佛所说的《药师经》。
药叉：即夜叉，又名捷疾鬼、能啖鬼。是鬼的一种，为天龙八部众中之一。
健达缚：即乾闼婆，意译香神，为天龙八部众中之一。乐神名。不食酒肉，唯求香以资阴身，又自其阴身出香，故有香神之称。为奉侍帝释司奏伎乐者。
阿素洛：即阿修罗，意译无酒、飞天等。为天龙八部众中之一。常与帝释战斗之神。
揭路荼：即迦楼罗。鸟名，亦名金翅鸟、妙翅鸟等。为天龙八部众中之一。居四天下之大树，取龙为食。
紧捺洛：即紧那罗，意译歌神。为天龙八部众中之一。乐神名。能作歌舞。
莫呼洛伽：即摩目侯罗伽。为天龙八部众中之一。是大蟒神，其形人身而蛇首。
信受奉行：佛经文末用语“信”即深信无疑，“受”即完全领受，“奉”即尊奉佛的教导，“行”即学习修行。信受如来所说之法而奉行之，即称“信受奉行”。
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Shou Ji Xue Fo Wang